Mit Autofilter ausgeschlossene Zeilen übergehen

ich habe eine Tabelle mit einer relativ komplexen Farbsteuerung gebastelt. Zum Einsatz kommt u.A. untenstehendes Makro. Klappt so weit auch wunderbar.
Problem:
Wenn ich nun über Autofilter die angezeigten Zeilen nach bestimmten Kriterien eingeschränkt habe, werden trotzdem alle Zeilen, auch die unsichtbaren, abgearbeitet. Wie kann ich das verhindern?
Beispiel: Durch Autofilter sind nur die Zeilen 1, 2, 1000 und 3000 sichtbar. Markiere ich nun die Zeilen 2 und 1000, werden auch die Zeilen 3-999 abgearbeitet. Das dauert natürlich.

Gruß Jens